התוכנית הרב-שנתית המשרדית מורכבת מחמש מטרות הכוללות את העשייה החינוכית על כלל גווניה ומשמשות נדבך בהתפתחות המערכת בשנים האחרונות. מטרות אלו משלימות זו את זו ומורכבות מ-15 יעדים מערכתיים. היעדים המערכתיים מיתרגמים אחרת ליעדי מוסדות החינוך שכן אופי העשייה והיקפה שונים בין רמת המערכת לרמה הבית ספרית. אולם כל רובדי המערכת מכוונים לאותן חמש מטרות, ברזולוציות שונות.
שימו לב! יעדים אלו שונים מיעדי המתנ"ה ליסודי ולחטיבת ביניים ומכוונים רק למטה ולמחוזות ולא לבתי הספר.